NetBeans を Vista でインストールするには User Account Control をオフにする必要があります。そうしないとエラーはでませんが何もインストールされません。コントロールパネル>ユーザーアカウント>ユーザーアカウント制御のオン、オフから UAC をオフにした後にインストールします。Tomcat や GlassFish をインストールしてしまった場合はこれらのプログラムを削除します。
参考: Windows Vista でプラグインのインストールの問題を回避するにはどうしたらよいですか?